صندوق قبر شیخ صفی‌الدین از قطعات چوبی به هم پیوسته ساخته شده و تقریباً چهار الوار قهوه‌ای دارد.
به گزارش دیدشهر، مقبره شیخ صفی الدین در قدیمی‌ترین بخش بقعه واقع شده و به صورت یک برج بلند است و جداره مقبره، چوبی و قهوه‌ای رنگ بوده و دیوار مقبره از پارچه کتانی نقاشی شده پوشیده شده و رنگ غالب در آن، قرمز لاکی است و مقبره دوپوش و به رنگ سفید است که در وسط آن طرح شمسه، ترنج و نیم ترنج نقاشی شده روی پارچه مشاهده می‌شود.
صندوق قبر شیخ صفی‌الدین از قطعات چوبی به هم پیوسته ساخته شده و تقریباً چهار الوار قهوه‌ای دارد و بدنه نقره‌ای برجسته‌ای با زمینه لاجوردی روی صندوق از روبرو تعبیه شده و در قسمت چپ مقبره از کاشی خشتی قهوه‌ای روشن استفاه شده است.
بنابر روایتی این صندوق از هندوستان آمده و هدیه امپراطور مغول بوده است. چهارگوشه صندوق سابقاً دارای چهار گوی طلا بوده که با جواهراتی مانند یاقوت، زمرد، فیروزه و غیره تصریع شده بوده و اطراف قسمت فوقانی صندوق به نظر می‌رسد زمانی مطلا بوده است و صندوق با ظاهر شگفت‌انگیزش دنیایی از طرح و نقش را در خود دارد و شامل تقسیمات مختلف است.
در متن صندوق، تقسیمات هندسی شش ضلعی‌ها و چهار ضلعی‌ها دور تا دور آن را تزیین کرده است و بخش داخلی به صورت مشبک از جنس آج بوده و طرح‌های اسلیمی با حاشیه خاتم و فیروزه کاری جلوه خاصی به طرح کلی صندوق داده است. در این صندوق مشبک عاج فیل خاتم کاری، منبت عاج فیل و منبت چوب به صورت عجیبی با همدیگر ترکیب شده‌اند و در بخش‌هایی از آن، استخوان سبز شده و در بعضی نقاط سنگ‌های قیمتی به کار برده شده است.
