زیارتگاه ها از جمله یکی از مهمترین جاذبه های گردشگری مذهبی در هر شهر بحساب می آید ززیارتگاه پیر تقی مشکول نیز یکی از قدیمی ترین این زیارتگاه ها است که گردشگران زیادی را جذب این منطقه می کند.
بقعه امامزاده دانیال که از نوادگان امام موسی الکاظم است در چهار کیلومتری شهرستان خلخال قرار دارد.
در منطقه شاهرود از توابع شهرستان خلخال روستایی قرار گرفته به نام گیلوان که مزار امامزاده عینعلی (ع) می باشد.
بنای امامزاده سید محمد قریشی در مرکز شهر هشتجین جنب مسجد شهر واقع شده است.
یکی از مراکز گردشگری مذهبی شهرستان خلخال امامزاده عبدالله کلور در بخش شاهرود شهرستان خلخال در شهر کلور است.
امامزاده سیدابوالقاسم(ع) در ۱۲ کیلومتری شمال شرق خلخال قرار دارد بعلت گذشته زمان فرسوده شده بود که بیش از ۲۰۰ میلیون تومان برای بازسازی و اتمام این حرم اختصاص یافته است.